После переноса ownCloud 9.0.0 на новый сервер, с сохранением всех файлов и базы, некоторые пользователи стали жаловаться на пропадание некоторых расшаренных ресурсов.
Быстрый поиск в google подсказал верное решение — очистить (truncate) таблицу oc_filecache. После очистки понаблюдал за поведением таблицы — записи о файлах стали потихоньку появляться, вроде всё открывалось. Но это ещё не было концом проблемы.